I. Văn phòng và các phòng chuyên môn, nghiệp vụ thuộc Sở Y tế

1. Văn Phòng

2. Phòng Tổ chức cán bộ

3. Phòng Nghiệp vụ Y

4. Phòng Nghiệp vụ Dược

5. Phòng Kế hoạch - Tài chính

6. Phòng Bảo trợ xã hội - Trẻ em

II. Chi cục thuộc Sở Y tế

1. Chi cục Dân số tỉnh Vĩnh Long

2. Chi cục An toàn thực phẩm tỉnh Vĩnh Long

III. Đơn vị sự nghiệp công lập thuộc Sở Y tế

1. Trung tâm Kiểm soát bệnh tật Vĩnh Long

2. Trung tâm Kiểm soát Dược phẩm, Mỹ phẩm, Thực phẩm và Thiết bị Y tế Vĩnh Long

3. Trung tâm Pháp y Vĩnh Long

4. Trung tâm Giám định Y khoa Vĩnh Long

5. Trung tâm Công tác xã hội Vĩnh Long

6. Trung tâm Bảo trợ xã hội Trà Vinh

7.  Trung tâm Bảo trợ và Cung cấp dịch vụ công tác xã hội Bến Tre

8.  Trung tâm Bảo trợ Người tâm thần Bến Tre

9. Bệnh viện Đa khoa Vĩnh Long

10. Bệnh viện Đa khoa Khu vực Hòa Phú

11. Bệnh viện Đa khoa khu vực kết hợp quân dân y

12. Bệnh viện Chuyên Khoa Mắt Vĩnh Long

13. Bệnh viện Phổi Vĩnh Long

14. Bệnh viện Tâm thần Vĩnh Long

15. Bệnh viện Y dược Cổ truyền Vĩnh Long

16.  Bệnh viện Đa khoa Trà Vinh

17.  Bệnh viện Phổi Trà Vinh

18.  Bệnh viện Sản - Nhi Trà Vinh

19.  Bệnh viện Y dược cổ truyền Trà Vinh

20.  Bệnh viện Phục hồi chức năng Trà Vinh

21.  Bệnh viện Đa khoa khu vực Tiểu Cần

22.  Bệnh viện Đa khoa khu vực Cầu Ngang

23.  Bệnh viện Nguyễn Đình Chiểu

24.  Bệnh viện Đa khoa Khu vực Cù Lao Minh

25.  Bệnh viện Đa khoa khu vực Ba Tri

26.  Bệnh viện Y học cổ truyền Trần Văn An

27.  Bệnh viện Phổi Bến Tre

28.  Bệnh viện Tâm thần Bến Tre

29. Trung tâm Y tế khu vực Vĩnh Long

30. Trung tâm Y tế khu vực Long Hồ

31. Trung tâm Y tế khu vực Mang Thít

32. Trung tâm Y tế khu vực Nguyễn Văn Thủ

33. Trung tâm Y tế khu vực Tam Bình

34. Trung tâm Y tế khu vực Trà Ôn

35. Trung tâm Y tế khu vực Bình Tân

36. Trung tâm Y tế khu vực Bình Minh

37.  Trung tâm Y tế khu vực Trà Vinh

38.  Trung tâm Y tế khu vực Châu Thành A

39.  Trung tâm Y tế khu vực Cầu Ngang

40.  Trung tâm Y tế khu vực Tiểu Cần

41.  Trung tâm Y tế khu vực Duyên Hải

42.  Trung tâm Y tế khu vực Càng Long

43.  Trung tâm Y tế khu vực Cầu Kè

44.  Trung tâm Y tế khu vực Trà Cú

45.  Trung tâm Y tế khu vực Long Thành

46.  Trung tâm y tế khu vực Bến Tre

47.  Trung tâm Y tế khu vực Mỏ Cày Nam

48.  Trung tâm Y tế khu vực Mỏ Cày Bắc

49.  Trung tâm Y tế khu vực Ba Tri

50.  Trung tâm Y tế khu vực Chợ Lách

51.  Trung tâm Y tế khu vực Thạnh Phú

52.  Trung tâm Y tế khu vực Giồng Trôm

53.  Trung tâm Y tế khu vực Bình Đại

54.  Trung tâm Y tế khu vực Châu Thành